Mit ihrer Schwerpunktbildung in der Forschung erfüllt die Johannes Gutenberg-Universität Mainz (JGU) eine der wesentlichen Voraussetzungen für ihre internationale Konkurrenzfähigkeit und ist damit sehr erfolgreich. Weltweit führend sind die Mainzer Teilchenphysikerinnen und -physiker, die im Exzellenzcluster PRISMA⁺⁺ forschen. Aber auch in anderen Bereichen ist die JGU maßgebend, etwa in den Materialwissenschaften, der Quanten- und Atomphysik, der nachhaltigen Chemie und der Polymerchemie sowie in den Lebenswissenschaften und der translationalen Medizin.

Die JGU bildet gemeinsam mit der Goethe-Universität Frankfurt und der Technischen Universität Darmstadt die Allianz der Rhein-Main-Universitäten (RMU). Die RMU wird ab 2027 im Rahmen der Exzellenzstrategie des Bundes und der Länder als Exzellenzverbund gefördert. Ermöglicht wurde dies durch den großen Erfolg der drei Universitäten in der Förderlinie Exzellenzcluster sowie die positive Bewertung des gemeinsamen Antrags unter dem Titel „RMU-EXCITE – Excellent. Collaborative. Transformative“.